Sedan civilisationens början har han dyrkats som en gud. Apocalypse, den förste och mäktigaste mutanten från Marvels X-Men-universum, samlade ihop krafter från många andra mutanter för att bli odödlig och osårbar. När han vaknar upp tusentals år senare ogillar han världen han ser. Han rekryterar mäktiga mutanter, bland annat en nedslagen Magneto, för att rena mänskligheten och skapa en ny världsordning med sig som härskare. Medan Jordens öde hänger på en tråd, måste Raven ta hjälp av Professor X för att leda en grupp av unga X-men för att stoppa deras störste fiende, och förhindra mänsklighetens undergång.